- Langue du parcours :Français
- ECTS :120
- Volume horaire TPTDCICM
- Formation initialeFormation continue
- ApprentissageContrat de professionnalisation
- Stage : durée (en semaines):27
Objectifs du programme
Ce parcours à vocation à développer deux aspects de la biologie structurale intégrative :
- la compréhension des fonctions à partir des données structurales, de l'échelle atomique de la vision cellulaire.
- La "biologie in silico" (analyse, l'exploitation et valorisation des données biologique, "Big data" pour les problèmes biologiques, modélisation moléculaire et simulations des systèmes biologiques)
Compétences à acquérir
En complément et en synergie avec les compétences génériques de la mention, ce parcours permet à un étudiant de développer et de construire par le choix de modules appropriés, l'une des quatre compétences suivantes :
- bio-structure : expertise des méthodes et des techniques de la biologie structurale et de l'analyse fonctionnelle des structures 3D,
- bio-analyse : expertise des méthodes et des outils de la "biologie in silico",
- bio-modélisation : expertise en modélisation des systèmes biologiques,
- génie bio-informatique : développements et gestions d'outils et de bases de données spécifiques pour la biologie.
Contact(s)
Jean Cavarelli
Jean-Marie Wurtz
Équipe pédagogique
Brett Johnson
Annick Dejaegere-Stote
Mikhail Eltsov
Luc Bonnefond
Arnaud Poterszman
Tahar Bellem
Victor Fernandes
Bruno Kieffer
Vincent Cura
Jean-Michel Dischler
Jean-Luc Dortet-Bernadet
Odile Lecompte
Fabrice Jossinet
Bruno Klaholz
Ouverture du programme
Programme ouvert à partir du 01/09/2108
Période durant laquelle le programme est dispensé
Le programme est dispensé selon le calendrier de la Faculté des Sciences de la Vie.
Semestres pairs : septembre à décembre
Semestres impairs : janvier à juin.
Pour le stage M2S4, les présentations orales ont lieu mi-juin.
Semestres pairs : septembre à décembre
Semestres impairs : janvier à juin.
Pour le stage M2S4, les présentations orales ont lieu mi-juin.
Modalités d'inscription
Selon les modalités prévues par la faculté des sciences de la vie.
Pré-requis obligatoires
Admission en M1
Ce parcours à l'interface biologie/chimie/mathématiques/informatique est exigeant et suppose donc l'acquisition et la validation d'une licence en sciences avec des résultats de bon niveau. Les dossiers d’étudiants motivés, non titulaires d’une licence sciences de la vie, mais souhaitant s’orienter vers les problématiques de recherche associées au master, peuvent déposer un dossier. Des compléments de formation seront cependant demandés en Master.
Examen sur dossier et entretiens si nécessaire.
Admission en M2
Apres validation d'un M1 avec des résultats universitaires de tres bon niveau, les dossiers de candidats ayant acquis des connaissances solide dans les techniques de la biologie structurale intégrative (Diffraction et diffusion des RX, RMN, Cryo-microscopie), en bioinformatique et génomique structurale peuvent être examinés.
Ce parcours à l'interface biologie/chimie/mathématiques/informatique est exigeant et suppose donc l'acquisition et la validation d'une licence en sciences avec des résultats de bon niveau. Les dossiers d’étudiants motivés, non titulaires d’une licence sciences de la vie, mais souhaitant s’orienter vers les problématiques de recherche associées au master, peuvent déposer un dossier. Des compléments de formation seront cependant demandés en Master.
Examen sur dossier et entretiens si nécessaire.
Admission en M2
Apres validation d'un M1 avec des résultats universitaires de tres bon niveau, les dossiers de candidats ayant acquis des connaissances solide dans les techniques de la biologie structurale intégrative (Diffraction et diffusion des RX, RMN, Cryo-microscopie), en bioinformatique et génomique structurale peuvent être examinés.
Pré-requis recommandés
Admission en M1
Cette spécialité compétitive et exigente, à capacité d'accueil limitée, aux interfaces de plusieurs champs disciplinaires, a vocation à accueillir des étudiants très motivés et ayant montré une grande capacité de travail.Cela doit se traduire dans les résultats universitaires obtenus en Licence par les postulants. La position de cette spécialité aux interfaces de plusieurs disciplines "traditionnelles" peut permettre d'accueillir d'excellents candidats ayant validé un parcours en sciences "généralistes" et souhaitant s'orienter vers les sciences du vivant.
Un premier examen du dossier de candidature vérifiera l'acquisition des enseignements fondamentaux en biologie et biophysico-chimie des macromolécules biologiques et une capacité de s'intégrer dans un processus aux interfaces biologie/chimie/physique/informatique. La position de ce parcours aux interfaces de plusieurs disciplines "traditionnelles" peut permettre d'accueillir d'excellents candidats ayant validé un parcours en sciences "généralistes" et souhaitant s'orienter vers les sciences du vivant.
Admission en M2
Le travail du M2 est en continuité et s'appuie sur les compétences et connaissances acquises en M1. Une entrée directe en M2 est relativement rare. Les candidats en M2 doivent avoir obtenu avec aisance les pré-requis obligatoires. Il ne faut envisager une entrée en M2 que pour des candidats ayant obtenu de tres bons résultats universitaires (en complément des prérequis indiqués).
Cette spécialité compétitive et exigente, à capacité d'accueil limitée, aux interfaces de plusieurs champs disciplinaires, a vocation à accueillir des étudiants très motivés et ayant montré une grande capacité de travail.Cela doit se traduire dans les résultats universitaires obtenus en Licence par les postulants. La position de cette spécialité aux interfaces de plusieurs disciplines "traditionnelles" peut permettre d'accueillir d'excellents candidats ayant validé un parcours en sciences "généralistes" et souhaitant s'orienter vers les sciences du vivant.
Un premier examen du dossier de candidature vérifiera l'acquisition des enseignements fondamentaux en biologie et biophysico-chimie des macromolécules biologiques et une capacité de s'intégrer dans un processus aux interfaces biologie/chimie/physique/informatique. La position de ce parcours aux interfaces de plusieurs disciplines "traditionnelles" peut permettre d'accueillir d'excellents candidats ayant validé un parcours en sciences "généralistes" et souhaitant s'orienter vers les sciences du vivant.
Admission en M2
Le travail du M2 est en continuité et s'appuie sur les compétences et connaissances acquises en M1. Une entrée directe en M2 est relativement rare. Les candidats en M2 doivent avoir obtenu avec aisance les pré-requis obligatoires. Il ne faut envisager une entrée en M2 que pour des candidats ayant obtenu de tres bons résultats universitaires (en complément des prérequis indiqués).
Poursuite d'étude
Ce parcours a vocation à former :
- des "techniciens" de haut niveau (sortie niveau BAC +5, directement à la fin du master),
- des futurs chercheurs (sortie niveau BAC +8 après un doctorat)
- Bac+5 : 60 à 70% des effectifs intègrent le marché du travail à la sortie du master au bout de 6 à 12 mois, pour moitié dans le privé et pour moitié dans le domaine public. Les étudiants sont recrutés en tant que ingénieur d'étude bio-informaticien ou gestionnaire de données ou encore comme technicien de laboratoire (biologie structurale, biotechnologie, ...).
- Bac+8 : 30 à 40% des étudiants ont pu obtenir un financement pour s’inscrire dans une école doctorale et préparer un doctorat.
Programme des enseignements
Biologie structurale intégrative et bio-informatique
- CMCITDTPTE
Analyse des séquences macromoléculaires - 3 ECTS
Détermination des structures 3D-1 - 3 ECTS
Modélisation moléculaire - 3 ECTS
Introduction à la programmation avec Java - 3 ECTS
Langues M1S1 - 3 ECTS
Mécanismes fondamentaux en sciences du vivant : des structures 3D aux fonctions - 3 ECTS
Outils mathématiques et informatique - 3 ECTS
Méthodes d'études des complexes et assemblages macromoléculaires - 3 ECTS
Programmation Orientée objet avec Java - 3 ECTS
Mathématiques et statistiques en BSIB - 3 ECTS
- CMCITDTPTE
Détermination des structures 3D en biologie II - 3 ECTS
Constructions et manipulation 3D des informations structurales - 3 ECTS
Omics : analyse de génomes et épigénomes - 3 ECTS
Initiation à la démarche scientifique en biologie structurale intégrative et bioinformatique - 9 ECTS
Insertion professionnelle - 3 ECTS
Langues M1S2 - 3 ECTS
- CMCITDTPTE
Transcriptome et protéomes - 3 ECTS
Structure et dynamique des macromolécules biologiques : Méthodes et concepts - 3 ECTS
Mini stage en laboratoire - 9 ECTS
Structures macromoléculaires et découvertes de médicaments - 3 ECTS
Imaging methods in integrated structural biology : Toward structural cell biology - 3 ECTS
Productions des échantillons biologiques pour les études structurales - 3 ECTS
Comparative and Medical Genomics - 3 ECTS
Biologie des systèmes : Introduction aux réseaux biologiques - 3 ECTS
Algorithmiques et Structure des données - 3 ECTS
Les architectures du Big Data - 3 ECTS
Mathématiques et Statistiques à l'ère du Big Data - 3 ECTS
UE obligatoire du tronc commun semestre 3 M2 BSIB 15 ects
Documents PDF à télécharger
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