Méthodes d'étude des interactions moléculaires
Master Sciences du vivantParcours Bioinformatique et bioimagerie structurale (BBS)
Description
Cette UE propose un panorama complet et actualisé des approches biochimiques et biophysiques permettant l’étude des interactions macromoléculaires stables ou transitoires. L’un des objectifs principaux est de fournir aux étudiants les outils d’analyse aussi bien théoriques que techniques des équilibres entre macromolécules.
• Bases théoriques des approches biophysiques mises en oeuvre (spectrométrie de masse,
fluorescence, thermochimie,…).
• Aspects énergétiques et cinétiques des mécanismes d’assemblages (microcalorimétrie,
EMSA, biosenseurs, fluorescence), traitement des équilibres de fixation/allostérie.
• Approches hydrodynamiques permettant d’évaluer facteurs de diffusion et/ou facteurs de
forme dont les techniques d'ultracentrifugation analytique et de mesures de corrélation ou
d'anisotropie de fluorescence.
• Techniques permettant la mesure de la taille et forme des complexes macromoléculaires
incluant la spectrométrie de masse adaptée à l’étude des complexes non covalents et les
approches basées sur les techniques de diffusion de la lumière (diffusion statique de la
lumière, diffusion des rayons X ou des neutrons). Les applications pratiques seront abordées lors des TP par l'analyse de données issues d’expériences. Les étudiants auront un aperçu de l'instrumentation lors de visites de la plateforme de biologie structurale intégrative.
Compétences requises
Notions de base en structures de protéines et équilibres chimiques (niveau licence de biochimie ou équivalent)Compétences visées
• Acquérir une bonne compréhension de la notion d’équilibre et d’affinité entre molécules biologiques et savoir les mesurer.
• Savoir choisir une stratégie appropriée pour l’étude d’un complexe et en appréhender les contraintes liées à son utilisation.
• Apprendre à utiliser les ressources documentaires appropriées (bases de données dédiées à l’étude de complexes)
• Savoir interpréter les résultats d’expériences extraites de publications.
Disciplines
- Biochimie et biologie moléculaire
- Biophysique et imagerie médicale
