Description

Cette UE a pour objectif principal de permettre l’acquisition et la consolidation de connaissances fondamentales en génétique quantitative et en génétique des populations. Elle s’attache à l’analyse de caractères continus et discontinus ainsi qu’à l’étude des bases génétiques de la microévolution à partir de concepts théoriques et d’observations issues du monde animal et végétal. Elle appréhende la diversité génétique et la structuration génétique des populations naturelles au moyen de logiciels d’analyse (Arlequin, Genepop, ACP, Structure) dans une optique de gestion de la biodiversité et de conservation des espèces.

Contenus des CM de génétique quantitative 
Notions de base en génétique quantitative : Génétique et traits quantitatifs ; Population et distribution phénotypique ; Positionnement de la variance phénotypique ; Composante génétique (additive et non additive)
Héritabilité au sens large et stricte ; Quantitative Trait Locus (QTL)
Cartographie des QTL : Principe de base ; Analyse de liaison ; Analyse pangénomique d’association
Illustration de dissection de traits complexes : Résistances aux antifongiques et analyse de liaison ; Maladie humaine et analyse pangénomique d’association

Contenus des CM de génétique des populations
Diversité génétique des espèces et populations animales, marqueurs du polymorphisme génétique, épigénétique
Mesures de la diversité génétique intra- et inter-populations : fréquences phénotypiques, génotypiques, et alléliques ; hétérozygotie ; diversités alléliques, haplotypiques et nucléotidiques
Modèle de Hardy-Weinberg : conditions, application
Liaison génétique et déséquilibre gamétique
Ecarts à la panmixie
Forces évolutives : dérive génétique, effectif efficace, effet fondateur, goulot d’étranglement, mutation, migration et flux de gènes
Outils informatiques, statistiques et représentations graphiques : Arlequin, Genepop, ACP, Structure

Compétences requises

Notions de base en génétique fondamentale et génétique expérimentale.

Compétences visées

L’étudiant-e devra être capable de :
Mobiliser des compétences transversales disciplinaires (biologie moléculaire, biologie cellulaire, génétique mendélienne, statistiques, écologie,…) ;
Acquérir ou consolider les concepts de génétique quantitative et de génétique des populations acquis en Licence ;
Estimer la diversité génétique d’une population à partir de différents indices de mesure ;
Etablir si une population est ou n’est pas à l’équilibre de Hardy-Weinberg en s’aidant de tests statistiques ;
Calculer un écart à la panmixie, un effectif efficace ou des valeurs sélectives et déterminer quelle(s) force(s) évolutive(s) a(ont) joué un rôle dans l’évolution de la population animale étudiée
Savoir retrouver ces concepts dans la littérature scientifique

Disciplines

• Biologie des populations et écologie

Contacts

Responsable(s) de l'enseignement

• Christine Keyser

Autres contacts

Enseignant pour la partie Génétique Quantitative : Joseph SCHACHERER