Méthodes et outils statistiques pour la recherche en écologie
Master Sciences du vivantParcours Plantes, environnement et génie écologique (PEnGé)
Description
Cet enseignement a pour objectif de présenter les différentes méthodes et outils statistiques utilisés classiquement en écologie, tests d’hypothèses, corrélations, régressions, analyses multivariées… Cet enseignement est accompagné de phases pratiques de mise en application des méthodes enseignées sur le logiciel R.
Cotenu des CM : Rappel sur les principaux tests statistiques, distinction entre facteurs explicatifs et variables réponses, définition des conditions d’applications, des risques d’erreur, prise en compte des pseudoréplications, de la colinéarité…
Statistiques descriptives, analyses multivariées de type ordination (ACP, AFC, PCO, NMDS) et classification (CAH, K-moyennes).
Statistiques inférentielles, corrélations, régressions simple et multiples (effets fixes, aléatoires, emboîtés…).
Exemples appliqués en écologie.
Contenu des TP-TD : Familiarisation à l’utilisation du logiciel R. Revue des différentes fonctionnalités de R pour les représentations graphiques, export des données et graphiques. Réalisation d’analyses multivariées de type ordination (ACP, AFC, PCO, NMDS) et classification (CAH, K-moyennes). Réalisation de tableau de corrélation, de modèles linéaires simples, généralisés, multiples avec variables fixes et aléatoires.
Compétences requises
UE Outils fondamentaux en Statistique pour les sciences du vivant en M1 ou équivalents
Compétences visées
• Comprendre et être capable d’utiliser des notions de base (variables, tests conditionnels, boucles, fonctions, etc.) dans R
• Être capable de mobiliser et de mettre en œuvre des analyses statistiques adaptées aux données étudiées et de les interpréter
• Réaliser diverses représentations graphiques des données écologiques et environnementales
Disciplines
- Informatique
- Biologie des populations et écologie
Contacts
Responsable(s) de l'enseignement
Autres contacts
Laurent HARDION : laurent.hardion@live-cnrs.unistra.fr