Description

Cette UE s'adresse  à des étudiants qui ont déjà des des notions de base de génétique classique et également de génétique quantitative.
L’objectif de cette unité d’enseignement est d’introduire de manière appliquée les notions de génétique quantitative. La génération et l’analyse de données à haut-débit sera abordée dans le cadre de deux séries complémentaires de travaux pratiques à savoir expérimentaux et analytiques.
Cette UE s'articulera autour de deux parties, l'une expérimentale et l'autre analytique.
Travaux pratiques expérimentaux :
- Analyse de liaison classique (croisement, génération de la descendance, phénotypage)
- Analyse phénotypique de populations
- Détection expérimentale de variants génétiques dont des variants structurels
- Édition via CRISPR-Cas9
- Séquençage d’un génome complet via la stratégie Oxford Nanopore MinION
Travaux pratiques analytiques :
- Analyse des données de séquençage de type Oxford Nanopore avec détection des variants structurels
- Analyse des données de séquençage de Illumina pour des analyses de pool de descendants
- Analyses des distributions phenotypiques au sein de populations
- Recherche de loci impliqués dans des traits complexes (QTL)

Compétences requises

Compréhension et utilisation du vocabulaire de génétique quantitative 

Compétences visées

À la fin de l’UE l’étudiant-e devra être capable :
- Disséquer l’origine génétique de caractères complexes
- Acquérir des techniques pour des analyses de liaison génotype-phénotype 
- Séquencer une population de cartographie et des génomes complets 
- Analyser des données de séquençage à haut-débit

Disciplines

• Biologie des organismes
• Biologie des populations et écologie

Contacts

Responsable(s) de l'enseignement

• Joseph Schacherer