Introduction aux méthodes de biologie structurale
Master Sciences du vivantParcours Biologie et génétique moléculaire (BGM)
Description
Une première connaissance des 3 méthodes principales de détermination des structures 3D en biologie : Cristallographie des rayons X , Cryomicroscopie électronique, Résonance magnétique nucléaire en solution.
Cristallographie:
- Introduction à la détermination des structures 3D des macromolécules par cristallographie : Aperçu global du processus allant de la cristallisation à la structure 3D.
1. Notions succinctes de cristallographie géométrique (réseaux groupe d’espace).
2. Principe de diffraction des rayons X par des monocristaux. Loi de Bragg, résolution.
3. Description brève des techniques de cristallisation, de collecte des données, de détermination des phases et d'interprétation des cartes de densité électronique.
-Cryo-microscopie électronique : méthode d'étude des structures biologiques aux niveaux moléculaire et cellulaire.
1. Imagerie avec des électrons dans des conditions cryogéniques
2. Préparation d'échantillons biologiques pour la cryo-EM
3. Structure et principes de fonctionnement du cryo-microscope électronique
4. Formation et numérisation d'images cryo-EM
5. Caractéristiques des données cryo-EM : fonction de transfert de contraste, bruit, résolution
6. Méthodes de reconstruction 3D : analyse de particules uniques (SPA) et reconstruction tomographique- RMN des macromolécules biologiques. Méthodes d'étude de peptides et de protéines RMN: concepts de base. Introduction à la RMN des polymères biologiques (protéines et acides nucléiques). Applications de la RMN en biologie
Compétences requises
Compréhension des principes simples de biophysique (niveau licence de biochimie)
Compétences visées
Comprendre la méthodologie et partie technique d'une publication de structure de macromolécules biologiques. Pouvoir interpréter les données structurales issues de ces méthodes.
Disciplines
- Biochimie et biologie moléculaire
- Biophysique et imagerie médicale
