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Régulation et analyse de l'expression des gênes

  • Cours (CM) 28h
  • Cours intégrés (CI) -
  • Travaux dirigés (TD) -
  • Travaux pratiques (TP) 40h
  • Travail étudiant (TE) 24h

Langue de l'enseignement : Enseignements multilingues

Niveau de l'enseignement : C1-Autonome

Description du contenu de l'enseignement

Régulation de la Transcription et de la Traduction:
- Les mécanismes de régulation de la transcription des gènes chez les bactéries et les eucaryotes seront développés et approfondis. Contrôle de l'initiation et de l’élongation de la transcription.
- Régulation en réponse à des signaux extracellulaires.
- Contrôle de la structure de la chromatine et de la modification des histones.
- Régulation de la transcription par les ARN non codants.
- La régulation de la traduction procaryotique effectuée par les ARN non codants sera approfondie.

Etablissement et analyse de données NGS:
Grace aux récents progrès en matière de séquençage à haut débit, l’expression des gènes peut être désormais analysée à l’échelle du génome. De ce fait, un aspect de l’enseignement RAEG sera abordé sous forme de travaux pratiques qui permettrons de familiariser les étudiants aux approches expérimentales de pointe en génomique pour étudier l’expression des gènes.

- Des techniques tels que le RNA-seq ou ChIP-seq, liées au séquençage à haut débit, seront traitées du point de vue théorique et expérimental.
- Le processus expérimental sera traité dans son intégralité, de la mise en place de l’expérience en laboratoire à l’analyse finale des données ainsi leur interprétation biologique.
- L’analyse des données génomiques issus du séquençage à haut débit sera effectuée sur la plateforme Galaxy, accessible aux biologistes sans connaissances en programmation.
 

Compétences à acquérir

Régulation de la transcription et de la traduction:
Compréhension des mécanismes impliqués dans le contrôle de l’expression des gènes. Maîtrise des approches et des techniques utilisées pour l’étude de ces mécanismes. Analyse objective et critique de résultats expérimentaux issus de la littérature scientifique.

Etablissement et analyse de données NGS:
A l’issus de cet enseignement, les étudiants devraient être en mesure de :
  • Discerner les limites et les avantages des approches à bas/haut débit en fonction du processus biologique étudié.
  • D’appréhender une approche à l’échelle du génome, de la réalisation en laboratoire à l’analyse finale des données de séquençage.
  • D’analyser de manière autonome des données de séquençage à haut débit via la plateforme Galaxy.
  • De replacer les résultats d’analyse génomique dans leur contexte biologique.

Pré-requis obligatoires

Seuls les étudiants ayant suivi l'UE "Expression des Gènes et Biosynthèse des Protéines" pourront être admis à suivre cette UE.

Contact

Faculté des sciences de la vie

28 RUE GOETHE
67083 STRASBOURG
0368851810

Responsable

Richard Patryk Ngondo

Hubert Becker

Intervenants

Richard Patryk Ngondo

Hubert Becker


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