Université de Strasbourg
Accueil
Search & Find
Vous êtes ici :  Accueil   >   Formation   >   Nos formations 2018-2022

Structures macromoléculaires et découvertes de médicaments

  • Cours (CM) 14h
  • Cours intégrés (CI) -
  • Travaux dirigés (TD) 17h
  • Travaux pratiques (TP) -
  • Travail étudiant (TE) 20h

Langue de l'enseignement : Français

Description du contenu de l'enseignement

Le cours magistral traite des points suivants :
- Identification et optimisation de molécules bioactives : définition de la problématique
- Les bases de la reconnaissance moléculaire : aspects thermodynamiques et structuraux
- Evaluation des structures expérimentales de protéines : critères géométriques et énergétiques, résolution des ambiguités.
- Prédiction de l’interaction protéine-ligand : (1) description des sites de liaison, (2) gestion de la flexibilité moléculaire, (3) pharmacophore, (4) docking, et scoring.

Des enseignements dirigés seront réalisés en salle de ressources informatiques.

Ils portent sur : (1) l’analyse d’une structure de protéine de la ProteinDataBank, (2) la préparation d’une structure de protéine pour le drug design, (3) et les principales méthodes de drug design pour l’identification de molécules bioactives (pharmacophore, docking, criblage virtuel)

 

Compétences à acquérir

Dans cette UE, l’étudiant approfondit sa compréhension de la reconnaissance moléculaire. Il apprend à exploiter l’information structurale pour prédire l’effet d’une molécule de type médicament sur une protéine cible thérapeutique. Il manipule des concepts et outils utilisés dans l’industrie pharmaceutique pour l’identification et l’optimisation de nouveaux composés bioactifs.

L’étudiant devra être en mesure de :
  • Visualiser et interpréter la structure tridimensionnelle d’une protéine
  • Identifier et classer par importance les interactions cible thérapeutique / molécule bioactive.
  • Préparer une structure issue de la PDB pour des applications en drug design
  • Construire et utiliser un pharmacophore
  • Exécuter et évaluer un re-docking, un cross-docking
  • Réaliser le criblage virtuel d’une chimiothèque par docking ou par l’approche pharmacophore.

Pré-requis obligatoires

Connaissances solides en biochimie structurale (en particulier la structure des protéines).


 

Pré-requis recommandés

Connaissances des interactions moléculaires non covalentes (liaisons hydrogène, ionique et de Van der Waals).
Notions élémentaires de chimie (nom des fonctions chimiques communes, structure de Lewis, pKa).
Notions de base en modélisation moléculaire (champ de force, minimisation d'énergie).

Contact

Ecole Supérieure de Biotechnologie de Strasbourg

300 BOULEVARD SEBASTIEN BRANT
67412 ILLKIRCH-GRAFFENSTADEN
0368854510

Responsable

Esther Kellenberger

Intervenants

Gilles Marcou

Esther Kellenberger


MASTER - Sciences du vivant

Actualités

juin 3 2019

  Téléchargez le programme Expositions Parcours historique. L’histoire du Jardin retracée en 7...

juin 3 2019

Par : Claire DamesinProfesseure en écophysiologie végétaleUniversité Paris Sud - laboratoire...

Consulter toutes les actualités

JW Player goes here
  • Plateforme Biologie
  • Réseau Alumni