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Détermination des structures 3D en biologie II

  • Cours (CM) 24h
  • Cours intégrés (CI) -
  • Travaux dirigés (TD) 16h
  • Travaux pratiques (TP) -
  • Travail étudiant (TE) -

Langue de l'enseignement : Français

Description du contenu de l'enseignement

Cristallographie des rayons X sur des monocristaux, Résonance magnétique nucléaire en solution, Microscopie électronique.
Diffraction des rayons X par des moncristaux. Collecte et traitement des données de diffraction, interprétation des cartes de densité électronique, constructions et validations des modèles.

RMN:Principes de base des expériences RMN. Mouvements moléculaires et relaxation. Spectroscopie triple-résonance multidimensionnelle

Mircroscopie électrronique. Principes de convolution et reconstruction 3D. Techniques de préparations. Principe de convolution ; la fonction de transfert de contraste ; la fonction de corrélation ; les alignements ; principe de rétroprojection et reconstruction 3D.Techniques de préparation, aspects pratiques de : coloration négative, étalement, ombrage, cryo microscopie électronique, études dynamiques, cristaux 2D, fracture, coupes cellulaires, CEMOVIS/Tokuyasu / tomographie.
 

Compétences à acquérir

Une bonne connaissance des concepts et des stratégies utilisées par les 3 méthodes principales de détermination des structures 3D en biologie: Cristallographie des rayons X sur des monocristaux,Résonance magnétique nucléaire en solution, Microscopie électronique. Pour un problème biologique donné, savoir proposer une stratégie, intégrant si nécessaire différentes approches.
 

Bibliographie, lectures recommandées

P. Moore, Visualizing the Invisible: Imaging Techniques for the Structural Biologist.
J. Keeler, Understanding NMR Spectroscopy.

Pré-requis obligatoires

Le module D3D-I, M1S1 du parcours biologie structurale et bioinformatique, est un pré-requis.

Pré-requis recommandés

Le module D3D-I, M1S1 du parcours biologie structurale et bioinformatique, est un pré-requis.

Contact

Faculté des sciences de la vie

28 RUE GOETHE
67083 STRASBOURG
0368851810

Responsable

Intervenants

Bruno Klaholz


MASTER - Sciences du vivant

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