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Détermination des structures 3D-1

  • Cours (CM) 27h
  • Cours intégrés (CI) -
  • Travaux dirigés (TD) 12h
  • Travaux pratiques (TP) -
  • Travail étudiant (TE) -

Langue de l'enseignement : Français

Description du contenu de l'enseignement

Diffraction des Rayons X : Cristallogenèse, Cristallographie Géométrique, Diffraction des rayons X par des monocristaux, Méthodes de collecte des données de diffraction; Détermination des phases. Interprétation des cartes de densité électronique. Affinement des structures 3D, Critères de validation des structures.

RMN des macromolécules biologiques. Méthodes d'étude de peptides et de protéines RMN: concepts de base. Introduction à la RMN des polymères biologiques (protéines et acides nucléiques). Applications de la RMN en biologie

Mircoscopie électronique : Introduction et base de l’analyse d’images. Principes de base d’un microscope électronique ; préparation d’échantillon ; exemples en microscopie électronique. principes de base de l’analyse d’images.
Cryo microscopie électronique Principes de bases de la cryo microscopie électronique ; préparation d’échantillon / congélation. Principes de bases de la détermination de structure : numérisation, sélection de particules, correction de la fonction de transfert de contraste, alignements, attribution angulaire, reconstruction 3D, affinement de structure, interprétation
 

Compétences à acquérir

Une première connaissance des méthodes et des stratégies utilisées par les 3 méthodes principales de détermination des structures 3D en biologie: Cristallographie des rayons X sur des monocristaux, Résonance magnétique nucléaire en solution, Microscopie électronique. Comprendre les problèmes posés et les solutions proposées. Savoir intérpréter les données structurales issues de ces méthodes.
 

Bibliographie, lectures recommandées

P. Moore, Visualizing the Invisible: Imaging Techniques for the Structural Biologist.
J. Keeler, Understanding NMR Spectroscopy.

Pré-requis obligatoires

Voir Pré-requis d'admission en M1, parcours biologie structurale et bioinformatique

Pré-requis recommandés

Voir Pré-requis d'admission en M1, parcours biologie structurale et bioinformatique

Contact

Faculté des sciences de la vie

28 RUE GOETHE
67083 STRASBOURG
0368851810

Responsable

Intervenants

Bruno Klaholz


MASTER - Sciences du vivant

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