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Génomique des micro-organismes

  • Cours (CM) 24h
  • Cours intégrés (CI) -
  • Travaux dirigés (TD) 18h
  • Travaux pratiques (TP) 20h
  • Travail étudiant (TE) 72h

Langue de l'enseignement : Français

Description du contenu de l'enseignement

L'enseignement aborde les divers domaines de la génomique descriptive (séquences proprement dites et leur annotation), fonctionnelle (qui exploite les données de la génomique descriptive pour inventorier l'ensemble des ARN ou des protéines) et comparative (qui s'intéresse aux similarités et aux différences qui s'observent entre espèces différentes) par le biais d'un cours complété par de séances de TP et de TD. Sont ainsi traîtés :
• l’émergence et le développement des concepts majeurs
• les stratégies expérimentales de séquençage et d'annotation
• les méthodes d'étude du transcriptome et du protéome dans le contexte de la génomique des bactéries
• les transferts horizontaux et l’influence des îlots génomiques sur la plasticité des génomes procaryotes
• quelques applications biotechnologiques ou médicales
• l’évolution récente des approches dans le domaine de la génomique environnementale.

Compétences à acquérir

L’étudiant devra être capable de maitriser les divers concepts liés au développement de la génomique ainsi que les méthodes employées de manière à comprendre leur champ d’application et leurs limites, afin de pouvoir développer une analyse critique des concepts théoriques et des données expérimentales présentées dans la littérature scientifique.

Bibliographie, lectures recommandées

Bertin P., Michotey V., Normand P. (2011) Apports de la génomique et de la protéomique en écologie microbienne, in J.C. Bertrand, P. Caumette, P. Lebaron, P. Normand (eds) Ecologie Microbienne, pp. 877-891.

Bertin P., Michotey V., Normand P. (2015) Contributions of descriptive and functional genomics to microbial ecology, in J.C. Bertrand et al. (eds), Environmental Microbiology: Fundamentals and Applications: Microbial Ecology, Springer, pp. 831-846.

Contact

Faculté des sciences de la vie

28 RUE GOETHE
67083 STRASBOURG
0368851810

Responsable


MASTER - Sciences du vivant

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